L'église est le joyau du collège St-Michel. Construite entre 1606 et 1613 dans un gothique tardif, elle fut totalement transformée au 18ème siècle en une église "Rococo".

Ses fresques, centrées autour de l'Archange St-Michel, racontent l'affrontement du bien et du mal ainsi que le salut offert aux hommes par Jésus-Christ. Le pèlerin y vénère les reliques de St-Pierre Canisius, lesquelles se trouvent dans le gisant sous le maître-autel.